服务器被入侵的排查方式：1、检查服务器日志信息是否被清除；2、检查服务器系统是否存在隐藏账户；3、检查服务器登录事件和日志记录；4、检查服务器已登录的全部用户；5、检查服务器是否存在异常流量；6、检查服务器数据库是否被入侵；7、检查服务器异常进程的脚本文件；8、检查服务器的系统文件是否被修改；9、检查服务器杀毒软件有没有出现误杀的情况；10、检查服务器是否存在网络安全漏洞。
具体内容如下：
1、查看日志信息是否还存在或者是否被清空，入侵者可能会删除机器的日志信息。
2、查找系统是否包含隐藏账户。
3、查看机器最近成功登陆的事件和最后一次不成功的登陆事件。如果是windows服务器，可以查看Windows日志等。
4、查看机器当前登录的全部用户。
5、查询服务器异常流量。
6、如果数据库被入侵，查看数据库登录日志等，如Sqlserver数据库支持设置记录用户登录成功和失败的日志信息。
7、查询异常进程所对应的执行脚本文件。
8、检测系统中的文件是否被删除或者更改。
9、可以安装服务器杀毒软件进行扫描查杀，一定要注意别被杀毒软件误杀。
10、检查网站安全漏洞等其他方面。
