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R语言的tcga_gene_exp_download.r怎么用

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tcga_gene_exp_download.r  脚本帮助

使用方法:

usage: tcga_gene_exp_download.r [-h] -p project [-f files.per.chunk]
                                [-o outdir]
TCGA 基因表达数据下载及临床数据下载与整理,详细帮助见:https://www.云搜网.com/article/1485
optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -p project, --project project
                        input project ID of TCGA, for example TCGA-STAD,more
                        project ID:https://www.云搜网.com/article/1061
                        [required]
  -f files.per.chunk, --files.per.chunk files.per.chunk
                        This will make the API method only download n
                        (files.per.chunk) files at a time. This may reduce the
                        download problems when the data size is too large
                        [default 10]
  -o outdir, --outdir outdir
                        output file directory [default cwd]

说明:

下载使用的R包为:TCGAbiolinks    长链非编码基因数据:gencodev22

使用命令示例:

Rscript tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-STAD

到此,关于“R语言的tcga_gene_exp_download.r怎么用”的学习就结束了,希望能够解决大家的疑惑。理论与实践的搭配能更好的帮助大家学习,快去试试吧!若想继续学习更多相关知识,请继续关注云搜网网站,小编会继续努力为大家带来更多实用的文章!

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