小编给大家分享一下如何使用awk筛选差异基因，相信大部分人都还不怎么了解，因此分享这篇文章给大家参考一下，希望大家阅读完这篇文章后大有收获，下面让我们一起去了解一下吧！
命令行筛选差异基因
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ID log2fc FDR gene1 1 0.001 gene2 -1 0.001 gene3 1 0.001 gene4 2 0.0001
筛选条件：log2fc的绝对值大于1，FDR<0.05
命令：
awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{if(FNR==1) print $0; else {abs_log2fc=($2<0?$2*(-1):$2);if(abs_log2fc>=1 && $3<0.05) print $0;}}' de_gene.txt
$2代表的是第二列的log2fc,你的文件的log2fc在哪一列就用$第几列，$3代表FDR，你的文件第几列是也是写$第几列
筛选差异基因存储到不同的文件
命令：
awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"; up="up"; dw="dw";}{if(FNR==1) {print $0 >up; print $0 >dw;} else if ($3<0.05) {if ($2>=1) print $0 >up; else if($2<=-1) print $0 >dw;}}' de_gene.txt
以上是“如何使用awk筛选差异基因”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家都有了一定的了解，希望分享的内容对大家有所帮助，如果还想学习更多知识，欢迎关注云搜网行业资讯频道！
