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aggregate可以对数据分组处理
limma包提供一个函数avereps可以对相同ID的数据取均值，识别的输入数据可以是matrix,MAList或者EList，后两者涉及芯片数据标准化过程，此处仅介绍如何针对matrix数据进行处理。
指定数据如下：相同type取均值
> dat type Num1 Num2 1 A 90 89 2 B 34 32 3 C 56 53 4 D 99 95 5 E 15 10 6 A 50 44 7 B 20 13 8 C 24 16 9 D 70 61 10 E 14 4
对数据除type列所有数据，按照type分类ID,取均值，结果：
> avereps(dat[,-1],ID=dat$type) Num1 Num2 A 70.0 66.5 B 27.0 22.5 C 40.0 34.5 D 84.5 78.0 E 14.5 7.0
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