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encode数据库,reptile database

如何查找 转录本ID在ensembl与refseq中的对应关系

Ensembl数据库地址:
http://grch37.ensembl.org/index.html

进入BioMart
香港vps
选择DataSet

点击左侧 Filter 可以选择一些条件
点击Attributes

点击GENE选择特征 ,勾选 Gene name , Transcript name

点击EXTERNAL, 在 External References 中选择需要转换对应的外部数据库的种类信息,勾选 Refseq的转录本ID

点击左上角RESULT ,再点击GO ,就可以导出结果了,这样就找到ensembl数据库中转录本的ID与Refseq数据库中转录本ID的对应关系了

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