本文小编为大家详细介绍“perl如何批量计算蛋白质分子量”，内容详细，步骤清晰，细节处理妥当，希望这篇“perl如何批量计算蛋白质分子量”文章能帮助大家解决疑惑，下面跟着小编的思路慢慢深入，一起来学习新知识吧。
perl脚本如下：
die "perl $0 <in> <out>" unless(@ARGV==2);
use Bio::SeqIO;
use Bio::Seq;
use Bio::Tools::SeqStats;
use Bio::Tools::pICalculator;
use Data::Dumper;
#读入序列
my $in = Bio::SeqIO->new(
-file => "$ARGV[0]",
-format => 'Fasta'
);
open OUT,">$ARGV[1]" or die "$!";
print OUT "#ID\tlength\tMV(Da)\tpI\n";
my $calc = Bio::Tools::pICalculator->new(-places => 2,-pKset => 'EMBOSS');
#逐条读取序列
while ( my $seq = $in->next_seq() ) {
my ( $id, $sequence, $desc ) = ( $seq->id, $seq->seq, $seq->desc );
my $weight = Bio::Tools::SeqStats ->get_mol_wt($seq);
$calc->seq($seq);
my $iep = $calc->iep;
print OUT sprintf("%s\t%s\t%s\t%s\n",
$seq->id,
$seq->length,
"$weight->[0]",
$iep);
}
$in->close();
close(OUT);
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